حسب الاعترافات التي أدلى بها بعض المشاركين في مجزرة سجن تدمر، وبحسب الهيكلية السياسية والعسكرية في الوحدات التي شاركت في المجزرة، فإنّ المتهمين في المجزرة الذين عُرفت أسماؤهم هم:
1. حافظ أسد (رئيس الجمهورية وقت المجزرة).
2. رفعت أسد (قائد سرايا الدفاع).
3. المقدم فيصل غانم (مدير سجن تدمر).
4. المقدم علي ديب ـ قائد اللواء (138) من سرايا الدفاع (من محافظ اللاذقية).
5. الرائد معين ناصيف ـ قائد اللواء (40) من سرايا الدفاع.
6. المقدم سليمان مصطفى ـ قائد أركان اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظة حماة).
7. الملازم أول ياسر باكير ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (محافظ حماة).
8. الملازم منير درويش ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (محافظ اللاذقية).
9. الملازم رئيف عبد الله ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (محافظة اللاذقية).
10. الرقيب محمد عمار ـ من حراس منزل معين ناصيف (من محافظ اللاذقية).
11. الرقيب علي موسى ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظ حمص).
12. الرقيب همام أحمد ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من جبلة).
13. الرقيب نزيه بلول ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع ( من محافظة حمص).
14. الرقيب طلال محي الدين أحمد ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظة اللاذقية).
15. الرقيب عيسى إبراهيم فياض ـ من حراسة منزل معين ناصيف (من محافظ اللاذقية).
16. الرقيب بدر منصور ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من جبلة).
17. العريف أكرم البيشاني ـ من حراسة منزل معين ناصيف (من محافظة طرطوس).
18. العريف إبراهيم يونس ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (محافظة حمص).
19. العريف إبراهيم مكنا ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من جبلة).
20. العريف طاهر زباري ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من جبلة).
21. العريف علي صالحة ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع ـ منطقة مصياف.
22. العريف عبد الرحمن هدلان ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع.
23. العريف ناصر عبد اللطيف ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظة طرطوس).
24. العريف غسان شحادة ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظة اللاذقية).
25. العريف حسين عيسى ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظة حمص).
26. العريف بشير قلو ـ من اللواء (40) من سرايا الدفاع (من محافظة حمص).